MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013205	AGG	2	6	188562	188567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510188
4502	NC_013205	ACC	2	6	188576	188581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510188
4503	NC_013205	CTTGC	2	10	188682	188691	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4504	NC_013205	T	6	6	188694	188699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_013205	CCG	2	6	188720	188725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_013205	AGGG	2	8	188783	188790	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_013205	TGGCA	2	10	188794	188803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4508	NC_013205	CGG	2	6	188804	188809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_013205	GC	3	6	188903	188908	0 %	0 %	50 %	50 %	258510189
4510	NC_013205	GC	3	6	188929	188934	0 %	0 %	50 %	50 %	258510189
4511	NC_013205	GGC	2	6	188989	188994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_013205	ATC	2	6	188999	189004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_013205	GCC	2	6	189008	189013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_013205	TTG	2	6	189016	189021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013205	CAT	2	6	189029	189034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_013205	GAT	2	6	189062	189067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_013205	TCA	2	6	189117	189122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510190
4518	NC_013205	CGG	2	6	189124	189129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510190
4519	NC_013205	GGA	2	6	189133	189138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510190
4520	NC_013205	CGG	3	9	189181	189189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510190
4521	NC_013205	CG	3	6	189196	189201	0 %	0 %	50 %	50 %	258510190
4522	NC_013205	TCA	2	6	189210	189215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510190
4523	NC_013205	CGA	2	6	189222	189227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510190
4524	NC_013205	CGA	2	6	189283	189288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510190
4525	NC_013205	GAT	2	6	189346	189351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510190
4526	NC_013205	TCT	2	6	189369	189374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510190
4527	NC_013205	CGT	2	6	189460	189465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510190
4528	NC_013205	CGG	2	6	189469	189474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510190
4529	NC_013205	ATG	2	6	189494	189499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510190
4530	NC_013205	CGAGGG	2	12	189517	189528	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258510190
4531	NC_013205	TGAT	2	8	189594	189601	25 %	50 %	25 %	0 %	258510190
4532	NC_013205	GGC	2	6	189630	189635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510190
4533	NC_013205	CGA	2	6	189682	189687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510190
4534	NC_013205	CGT	2	6	189697	189702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510190
4535	NC_013205	ACG	2	6	189708	189713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510190
4536	NC_013205	CGT	2	6	189751	189756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510190
4537	NC_013205	CGA	2	6	189802	189807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510190
4538	NC_013205	TG	3	6	189819	189824	0 %	50 %	50 %	0 %	258510190
4539	NC_013205	TTC	2	6	189986	189991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510191
4540	NC_013205	AG	3	6	190026	190031	50 %	0 %	50 %	0 %	258510191
4541	NC_013205	CAT	2	6	190066	190071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510191
4542	NC_013205	GCCG	2	8	190106	190113	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4543	NC_013205	GGC	2	6	190114	190119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4544	NC_013205	GGC	2	6	190235	190240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4545	NC_013205	ACG	2	6	190250	190255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4546	NC_013205	CGT	2	6	190271	190276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4547	NC_013205	GCC	2	6	190303	190308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510191
4548	NC_013205	GTG	2	6	190315	190320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510191
4549	NC_013205	CTCG	2	8	190323	190330	0 %	25 %	25 %	50 %	258510191
4550	NC_013205	GAC	2	6	190393	190398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4551	NC_013205	CGG	2	6	190438	190443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4552	NC_013205	GCG	2	6	190458	190463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4553	NC_013205	CGT	2	6	190538	190543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4554	NC_013205	CGC	2	6	190548	190553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510191
4555	NC_013205	CCT	2	6	190587	190592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510191
4556	NC_013205	CGA	2	6	190593	190598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4557	NC_013205	CGGG	2	8	190619	190626	0 %	0 %	75 %	25 %	258510191
4558	NC_013205	GGACGA	2	12	190635	190646	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258510191
4559	NC_013205	TCC	2	6	190652	190657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510191
4560	NC_013205	GTC	2	6	190684	190689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4561	NC_013205	CG	3	6	190701	190706	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4562	NC_013205	CCAGGG	2	12	190707	190718	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510191
4563	NC_013205	CCGAGG	2	12	190739	190750	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258510191
4564	NC_013205	GC	3	6	190752	190757	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4565	NC_013205	CG	3	6	190782	190787	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4566	NC_013205	TCG	2	6	190796	190801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4567	NC_013205	TGG	2	6	190835	190840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510191
4568	NC_013205	CGC	2	6	190857	190862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510191
4569	NC_013205	GGAG	2	8	190887	190894	25 %	0 %	75 %	0 %	258510191
4570	NC_013205	CCGCG	2	10	190942	190951	0 %	0 %	40 %	60 %	258510191
4571	NC_013205	CG	3	6	190998	191003	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4572	NC_013205	GC	3	6	191014	191019	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4573	NC_013205	GCG	2	6	191096	191101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4574	NC_013205	GACG	2	8	191115	191122	25 %	0 %	50 %	25 %	258510191
4575	NC_013205	GCC	2	6	191158	191163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510191
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4579	NC_013205	GCG	2	6	191314	191319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4580	NC_013205	CCGG	2	8	191344	191351	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4581	NC_013205	ACG	2	6	191401	191406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4582	NC_013205	TCG	2	6	191417	191422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4583	NC_013205	GCG	2	6	191471	191476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4584	NC_013205	G	6	6	191504	191509	0 %	0 %	100 %	0 %	258510191
4585	NC_013205	ACG	2	6	191512	191517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4586	NC_013205	GC	3	6	191528	191533	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4587	NC_013205	CG	3	6	191552	191557	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4588	NC_013205	GC	3	6	191581	191586	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4589	NC_013205	GCG	2	6	191600	191605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4590	NC_013205	ACG	2	6	191615	191620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510191
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4594	NC_013205	CGA	2	6	191733	191738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510191
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4596	NC_013205	CG	3	6	191768	191773	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4597	NC_013205	CG	3	6	191797	191802	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4598	NC_013205	CTCGTG	2	12	191806	191817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4599	NC_013205	CG	3	6	191844	191849	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4600	NC_013205	GGCG	2	8	191859	191866	0 %	0 %	75 %	25 %	258510191
4601	NC_013205	TGG	2	6	191876	191881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510191
4602	NC_013205	GCG	2	6	191912	191917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4603	NC_013205	CAT	2	6	191928	191933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510191
4604	NC_013205	CGG	2	6	191961	191966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4605	NC_013205	CG	3	6	191970	191975	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4606	NC_013205	GGC	2	6	192000	192005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4607	NC_013205	GCC	2	6	192007	192012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510191
4608	NC_013205	GC	3	6	192015	192020	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4609	NC_013205	GGC	2	6	192086	192091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510191
4610	NC_013205	GC	3	6	192118	192123	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4611	NC_013205	CGGC	2	8	192149	192156	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4612	NC_013205	GTG	2	6	192211	192216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510191
4613	NC_013205	CGT	2	6	192243	192248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4614	NC_013205	GGA	2	6	192249	192254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510191
4615	NC_013205	GGCGG	2	10	192255	192264	0 %	0 %	80 %	20 %	258510191
4616	NC_013205	CGA	2	6	192282	192287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510191
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4618	NC_013205	CG	3	6	192339	192344	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4619	NC_013205	CCT	2	6	192345	192350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510191
4620	NC_013205	TCT	2	6	192352	192357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510191
4621	NC_013205	GC	4	8	192364	192371	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4622	NC_013205	CGAG	2	8	192405	192412	25 %	0 %	50 %	25 %	258510191
4623	NC_013205	GGA	2	6	192447	192452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510191
4624	NC_013205	GTC	2	6	192454	192459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510191
4625	NC_013205	CGC	2	6	192482	192487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510191
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4628	NC_013205	GC	3	6	192512	192517	0 %	0 %	50 %	50 %	258510191
4629	NC_013205	CGC	2	6	192589	192594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_013205	CTAGTC	2	12	192604	192615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4632	NC_013205	CG	3	6	192641	192646	0 %	0 %	50 %	50 %	258510192
4633	NC_013205	GTC	2	6	192743	192748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510192
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4645	NC_013205	CGA	2	6	193377	193382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510192
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4647	NC_013205	CAT	2	6	193441	193446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510192
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4734	NC_013205	CGA	2	6	196625	196630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510196
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4868	NC_013205	CGGA	2	8	202900	202907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4869	NC_013205	CGA	2	6	202934	202939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4870	NC_013205	G	6	6	202988	202993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4871	NC_013205	TG	3	6	203000	203005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4872	NC_013205	GTC	2	6	203067	203072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4873	NC_013205	CAGA	2	8	203075	203082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4874	NC_013205	CGCA	2	8	203094	203101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4875	NC_013205	GGC	2	6	203107	203112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4876	NC_013205	GCGGT	2	10	203119	203128	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4961	NC_013205	GGA	2	6	207064	207069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4962	NC_013205	GAC	2	6	207199	207204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510209
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4972	NC_013205	GA	3	6	207531	207536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4980	NC_013205	TTCA	2	8	207957	207964	25 %	50 %	0 %	25 %	258510211
4981	NC_013205	TGTA	2	8	208061	208068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4982	NC_013205	CGG	2	6	208076	208081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4983	NC_013205	AGA	2	6	208193	208198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510212
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4985	NC_013205	GT	4	8	208343	208350	0 %	50 %	50 %	0 %	258510212
4986	NC_013205	CCG	2	6	208371	208376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510212
4987	NC_013205	GC	4	8	208387	208394	0 %	0 %	50 %	50 %	258510212
4988	NC_013205	CGCA	2	8	208430	208437	25 %	0 %	25 %	50 %	258510212
4989	NC_013205	CCA	2	6	208446	208451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510212
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4992	NC_013205	CGC	2	6	208573	208578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510212
4993	NC_013205	GAA	2	6	208600	208605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510212
4994	NC_013205	TCG	2	6	208695	208700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4995	NC_013205	CTGC	2	8	208732	208739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4996	NC_013205	CTT	2	6	208816	208821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510213
4997	NC_013205	GCCAA	2	10	208822	208831	40 %	0 %	20 %	40 %	258510213
4998	NC_013205	GCG	2	6	208837	208842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510213
4999	NC_013205	GCGCC	2	10	208881	208890	0 %	0 %	40 %	60 %	258510213
5000	NC_013205	GC	3	6	208901	208906	0 %	0 %	50 %	50 %	258510213

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